É filho de Mordko Majer Niskier e Fany Niskier, que imigraram para o Brasil.
Formando-se em pedagogia ainda na década de 1960, doutorou-se nesta área. Exerceu o magistério superior de História e Filosofia da Educação da Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ), aposentado-se em 1995.
Teve ainda diversos outros cursos, e participa de grande quantidade de associações e entidades pedagógicas, literárias e culturais.
Arnaldo Niskier é, também, académico correspondente da Academia das Ciências de Lisboa.