Jon Krakauer nasceu em Brookline, Massachusetts. Mudou-se para Corvallis - Oregon, aos dois anos. Competiu no tênis em Corvallis High School e graduou-se em 1972. No mesmo ano estudou no Hampshire College, em Massachusetts, e em 1976 recebe seu diploma em Estudos Ambientais.
Vencedor do prêmio do Clube Alpino Americano de literatura sobre montanhismo, Krakauer foi finalista no Nacional Magazine Award. Krakauer alcançou popularidade escrevendo para a revista Outsider, da qual também é editor.
Colabora ainda com várias revista entre elas a National Geogarfic e a GEO. Em 1999 recebeu da American Academy Of Arts And Letters, um prêmio pelo conjunto de sua obra jornalística.