Yotsuba Koiwai, é uma menina de 5 anos, enérgica, alegre, curiosa e peculiar, além de completamnte ignorante sobre muitas coisas que qualquer garota de sua idade já sabe. A história se inicia com a mudança de Yotsuba e seu pai, e com o surgimento de vínculos de amizade com suas vizinha e a mãe delas.