Depois de tomar parte na década de 1920, na campanha contra a Rússia Soviética, ele se formou em estudos jurídicos em Lwów, em seguida, estudou economia em Poznań. Bocheński obteve um doutorado em filosofia (ele estudou em Freiburg, 1928-31). Ele também era um ex-aluno da Universidade Pontifícia de são Tomás de Aquino, Angelicum em Roma, onde estudou Teologia Sagrada de 1931 a 1934 ganhar um doutorado em Teologia Sagrada. Bocheński era um professor de lógica na Angelicum até 1940.
Durante a II Guerra Mundial, ele serviu como capelão do exército polonês durante a invasão da Polônia de 1939, foi feito prisioneiro de guerra, escapou dos Alemães e chegou a Roma. Ele se juntou ao exército polonês e serviu como capelão primeiro na França, depois na Inglaterra. Lutou como soldado em 1944 na campanha italiana doII Corpo Polonês em Monte Cassino.
Em 1945, ele recebeu a cadeira na história da filosofia do século XX na Universidade de Friburgo (da qual foi reitor em 1964-66); ele fundou e dirigiu o Instituto da Europa Oriental e publicou a revista Estudos do Pensamento Soviético e uma série de livros sobre os fundamentos da filosofia marxista (Soviética).
Bocheński atuou como consultor de vários governos: Alemanha Ocidental (sob Konrad Adenauer), África do Sul, Estados Unidos, Argentina e Suíça.
Antes de 1989, nenhuma das suas obras foram publicadas oficialmente na Polónia.