Durante a Guerra de Secessão, nos Estados Unidos, cinco prisioneiros dos sulistas se apoderam de um balão e fogem. Mas, sobre o mar, o balão é atingido por uma tromba marinha e cai, e os fugitivos são lançados à praia de uma ilha desconhecida, que eles batizam com o nome de Lincoln. Ali encontram um mistério: alguém que eles não veem os ajuda a sobreviver e salvar um famoso ex-condenado que havia sido abandonado em uma ilha vizinha. Depois de muitas aventuras e perigos, os náufragos descobrem, durante uma exploração, o famoso submarino "Nautilus", do capitão Nemo, e encontram o velho capitão que lhes dá as condições para voltarem à pátria, junto com o ex-condenado que tinham salvado.
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