Durante a graduação em Geografia na Universidade de São Paulo (década de 1960) foi fortemente influenciada por Nice Lecocq Muller no que se refere à geografia urbana; com Pasquale Petrone conheceu o discurso crítico; teve ainda como professores Aroldo de Azevedo, Lea Goldenstein e Aziz Nacib Ab'Saber.[2] Na Universidade de Paris foi aluna de Pierre George e Yves Lacoste.[2] Fez Mestrado sob orientação de Celso Furtado e doutorado na Universidade de Paris; depois voltou para o Brasil onde começou a dar aula na Faculdade de Filosofia, Letras e Ciências Humanas da Universidade de São Paulo. De 1983 até 1986, Souza foi prefeita da Cidade Universitária Armando Salles de Oliveira em São Paulo.[3]
Também foi chefe do Gabinete do Reitor da mesma universidade.[4] Em 1989 tornou-se livre-docente na Faculdade de Filosofia, Letras e Ciências Humanas da Universidade de São Paulo com um trabalho sobre A identidade da metrópole: a verticalização em São Paulo. Foi responsável também por preparar os planos de governo de Paulo Skaf e Gabriel Chalita, atuando também como assessora em suas respectivas campanhas eleitorais ao governo e prefeitura de São Paulo em 2010 e 2012.
Ela é presidente do Instituto de Pesquisa, Informação e Planejamento Territorial, com sede em Campinas, assim como é presidente do Centro de Documentação e Estudos da Cidade de São Paulo (CEDESP).