Aí vem Mewtwo, o Super-Pokémon - e está tentando dominar o mundo! [Isso não é uma coisa boa!]
Os cientistas clonaram o lendário Pokémon Mew para criar Mewtwo, o Pokémon mais poderoso do mundo. Só que ninguém contava com um louco, quer dizer Mewtwo! Agora ele quer governar, e vai parar em nada para obter o seu caminho.
Mewtwo cria uma armadilha para melhores treinadores Pokémon do mundo. Ele planeja roubar seu Pokémon e fazer clones de super-desagradável - Clones fortes o suficiente para derrotar todos o verdadeiro Pokémon. Mesmo Ash e Pikachu não são páreo para Mewtwo e suas cópias astutos.
Agora só Mew pode salvar o mundo do poder Poké de Mewtwo. Mew, vai! É um confronto de dois problemas Pokémon.