Depois da intensiva crise de treinamento com o Green, Yellow está pronto pra investir em qualquer obstáculo que esteja no caminho dele? Ou ele não está? O primeiro teste da sua nova aventura como um Treinador Pokémon inclui investigar os misteriosos acontecimentos no porto de Vermillion e frustrar os planos malignos da nova e revivida Equipe Rocket! Yellow conseguirá enfrentar esses desafios?